Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
J3QQQ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms