Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IDSB3KWA1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IDSB3KWA1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms