Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms