Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD5Q9P267 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms