Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB6BQ9NRW1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms