Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLMPQ9H6B4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms