Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms