Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3DQ96BQ1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms