Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN4Q92575 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms