Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms