Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARP8Q8N3A8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms