Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms