Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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SAMD13Q5VXD3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAMD13Q5VXD3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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