Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OTUD3Q5T2D3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms