Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FHOD3Q2V2M9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms