Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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