Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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COL19A1Q14993 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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COL19A1Q14993 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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COL19A1Q14993 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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COL19A1Q14993 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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COL19A1Q14993 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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COL19A1Q14993 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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COL19A1Q14993 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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COL19A1Q14993 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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COL19A1Q14993 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL19A1Q14993 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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