Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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