Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms