Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms