Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms