Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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