Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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PGGT1BP53609 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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PGGT1BP53609 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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PGGT1BP53609 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PGGT1BP53609 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PGGT1BP53609 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PGGT1BP53609 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PGGT1BP53609 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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