Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCLCP48506 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCLCP48506 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GCLCP48506 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCLCP48506 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCLCP48506 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLCP48506 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLCP48506 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLCP48506 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLCP48506 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLCP48506 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLCP48506 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCLCP48506 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCLCP48506 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCLCP48506 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCLCP48506 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCLCP48506 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms