Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MSR1P21757 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSR1P21757 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSR1P21757 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms