Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms