Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FANCAO15360 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FANCAO15360 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FANCAO15360 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FANCAO15360 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FANCAO15360 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FANCAO15360 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCAO15360 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCAO15360 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCAO15360 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCAO15360 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCAO15360 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCAO15360 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCAO15360 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FANCAO15360 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms