Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CXCR6O00574 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms