Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROCC2H7BZ55 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms