Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNMT3AQ9Y6K1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNMT3AQ9Y6K1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3AQ9Y6K1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms