Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA3Q9Y6H8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GJA3Q9Y6H8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA3Q9Y6H8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms