Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPO11Q9Y5K1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPO11Q9Y5K1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPO11Q9Y5K1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms