Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN16Q9Y5I7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN16Q9Y5I7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms