Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHTOPQ9Y3Y2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms