Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R2

PTPN22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22Q9Y2R2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN22Q9Y2R2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN22Q9Y2R2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN22Q9Y2R2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN22Q9Y2R2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPN22Q9Y2R2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN22Q9Y2R2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN22Q9Y2R2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms