Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSUH2Q9Y2M2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSUH2Q9Y2M2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms