Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSX2IPQ9Y2D8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms