Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRAK1Q9UPV9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRAK1Q9UPV9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRAK1Q9UPV9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRAK1Q9UPV9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms