Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF2Q9UNY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TTF2Q9UNY4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTF2Q9UNY4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms