Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD4Q9ULV1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FZD4Q9ULV1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms