Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF490Q9ULM2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF490Q9ULM2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF490Q9ULM2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms