Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ZNF608Q9ULD9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
ZNF608Q9ULD9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ZNF608Q9ULD9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC41■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ZNF608Q9ULD9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ZNF608Q9ULD9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ZNF608Q9ULD9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms