Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
CHIC2Q9UKJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHIC2Q9UKJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHIC2Q9UKJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC2Q9UKJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms