Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FBXO3Q9UK99 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FBXO3Q9UK99 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FBXO3Q9UK99 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FBXO3Q9UK99 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FBXO3Q9UK99 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXO3Q9UK99 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FBXO3Q9UK99 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms