Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX4Q9UIU6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIX4Q9UIU6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIX4Q9UIU6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms