Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRBP1Q9UHY1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRBP1Q9UHY1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NRBP1Q9UHY1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NRBP1Q9UHY1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRBP1Q9UHY1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRBP1Q9UHY1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NRBP1Q9UHY1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms