Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED13Q9UHV7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED13Q9UHV7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED13Q9UHV7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms