Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3BQ9UH17 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC3BQ9UH17 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms