Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGXB4Q9UGU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGXB4Q9UGU5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HMGXB4Q9UGU5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms