Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE7Q9UBL6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPNE7Q9UBL6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE7Q9UBL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms